La cellule de contrôle interne et de suivi-évaluation (CCI-SE) a pour mission d’assurer la fonction de contrôle interne, de suivi-évaluation au sein de la DGSI. Elle est chargée de :

• organiser et suivre la mise en œuvre des règles et procédures au sein de la DGSI;
• lutter contre la corruption au sein de la DGSI;
• organiser les audits organisationnels et fonctionnels des structures de la DGSI;
• organiser les audits et investigations confiés par la Directrice Générale;
• organiser le processus de suivi-évaluation;
• élaborer et mettre en place les outils de suivi-évaluation;
• renforcer les capacités en matière de suivi-évaluation;
• élaborer les programmes et  rapports d’activité de la DGSI;
• produire les rapports de performances des structures  et organiser les séances de validation.