La Direction Générale comprend un Directeur Général qui définit les grandes orientations, coordonne et contrôle l’exécution des activités et évalue les performances, un Secrétariat chargé de la réception, du traitement, du classement, de l’expédition et de l’archivage du courrier. Il s’occupe également de la reprographie et de l’organisation des audiences.
La Direction Générale est composée d’une Cellule d’Appui technique (CAT ) qui assure l’étude et le traitement de tous dossiers à eux confiés par le Directeur Général ; d’un Responsable Qualité (RQ) chargé de l’élaboration et de la mise en œuvre du système de management de la qualité de la DGSI; d’un Responsable Sécurité du Système d’Information (RSSI) chargé de l’élaboration et de la mise en œuvre du système de management de la sécurité de l’information du ministère et enfin d’un Urbaniste du Système d’Information (USI) chargé de l’élaboration et de la mise en œuvre de la stratégie et du plan d’urbanisation du système d’information du ministère.